Московский музей Тропинина и художников его времени играет особую роль среди музеев столицы. 

Музей Матрешки в Леонтьевском переулке города Москвы размещается в здании бывшего Кустарного музея Губернского земства. Музей является филиалом Фонда народных промыслов.

Единственным музеем в России, коллекционные фонды которого объединили работы народного искусства, произведения выдающихся творцов прошлых лет и современности, является Всероссийский музей декоративно-прикладного и народного искусства.

Список московских музеев декоративно-прикладного и народного искусства.

В середине 2011 года в Москве был открыт еврейский музей, посвященный истории этого народа.

Частный Музей Русской Иконы на улице Гончарной в Москве является вторым частным музеем русской иконы в России.

Музей иконы на Спиридоновке (Дом иконы) был открыт в 2009 году и является центром русской иконописи и культуры.

Список краеведческих и геологических музеев города Москвы.